GCI,SPR,BLI動力學(xué)檢測
真實(shí)案例分享
在現(xiàn)代生物學(xué)、醫(yī)學(xué)及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)、藥物學(xué)等研究中,隨著功能基因組研究的深入,生物大小分子的生物學(xué)功能研究占具著非常重要的地位,生物大小分子的相互作用分析成為目前分子功能學(xué)研究中不可缺少的重要手段。
基于光學(xué)傳感器的實(shí)時(shí)無標(biāo)記動力學(xué)檢測方法靈敏度和準(zhǔn)確性高,因此成為目前主流的分子互作檢測方式,這些光學(xué)檢測方法目前主要分為GCI(光柵偶合干涉),SPR(表面等離子共振)以及BLI(生物層干涉)技術(shù)。在這些方法中,通常將蛋白質(zhì)受體分子固定在傳感器表面,然后注入配體(稱為分析物)使其流過傳感器。在特定的締合時(shí)間后(由受體結(jié)合位點(diǎn)的飽和度決定),將不包含配體的溶液通過流通池注入以解離受體-配體復(fù)合物(圖1)。受體和配體的結(jié)合和解離的變化將轉(zhuǎn)化為光的干涉圖案。這些變化基于與表面受體與配體分子結(jié)合的數(shù)量,并以傳感圖表示,從中可以計(jì)算出動力學(xué)締合常數(shù)(kon)和解離常數(shù)(koff),以及Kd(圖1)[1]。
圖1
在分享一些案例之前,我們先了解一下無標(biāo)記技術(shù)檢測分子間親和力和動力學(xué)的基本流程,如圖2所示
圖2
案例1:
實(shí)驗(yàn)步驟:將2ug/mL的Antibody1作為配體固化在ProteinA芯片上,固化水平為200RU。不同種屬的分析物Antigen1和Antigen2以100nM,30uL/min流經(jīng)固化有配體的芯片表面。結(jié)果如圖3(SPR),圖4(GCI)所示。
SPR技術(shù)
圖3
在這種情況下,研究員會對antigen2會繼續(xù)做動力學(xué)表征,而antigen1因?yàn)樾盘栔岛苋醣徽J(rèn)為是陰性樣品。
GCI技術(shù)(WAVE system)
圖4
在配體固化水平及分析物濃度相同的條件下,GCI技術(shù)在單一濃度分析的過程中可得到穩(wěn)定的結(jié)合信號,研究人員在這種情況下會繼續(xù)完成此樣品的動力學(xué)分析。為后續(xù)的研究提供更多可參考的信息。
案例2:
接著我們繼續(xù)對比一些SPR信號值很弱的陰性樣品,同樣保持相同的固化水平,濃度,流速等條件。結(jié)果如圖5,圖6所示
圖5
圖6
在這些案例中不難看出,GCI的靈敏度非常高,這是由于SPR的漸逝場檢測的范圍僅有100nm,(圖7),而GCI技術(shù)將光路延伸至整個(gè)2mm傳感器(圖8),漸逝場覆蓋范圍更廣,可檢測的相互作用更多。
BLI技術(shù)因其較高的通量以及無管路的設(shè)計(jì)常應(yīng)用在上清液的動力學(xué)表征,而GCI技術(shù)特有的RAPID模式可實(shí)現(xiàn)脈沖式進(jìn)樣縮短來樣品飽和時(shí)間,并且無需對分析物進(jìn)行梯度稀釋,極大的縮短了樣品準(zhǔn)備時(shí)間,獨(dú)特的微流路外置在芯片上(圖9)的設(shè)計(jì)避免了管路堵塞的風(fēng)險(xiǎn),同樣適用于上清液的動力學(xué)表征。下面讓我們一起來看幾個(gè)案例。
圖9
案例3:
實(shí)驗(yàn)步驟:將胞外表達(dá)的培養(yǎng)基上清液中未知濃度的8個(gè)抗體固化在ProteinA傳感器上,與100nM的分析物(抗原)相互作用的結(jié)果如圖10(BLI),圖11(GCI)。
BLI技術(shù)(8通道)
GCI技術(shù)(WAVE system)
所測得的動力學(xué)數(shù)據(jù)表1:
表1
所測的8個(gè)樣品中,BLI中有5個(gè)超過了檢測限,而GCI只有2個(gè),這是由于BLI無管路的設(shè)計(jì),導(dǎo)致親和力較高的樣品二次結(jié)合(rebinding)。
8個(gè)樣品BLI總耗時(shí)1個(gè)半小時(shí),GCI耗時(shí)2個(gè)半小時(shí),但BLI技術(shù)因其浸入式的傳感器設(shè)計(jì)導(dǎo)致樣品揮發(fā)所以樣品放置時(shí)間不宜過長,運(yùn)行過程中需人員值守。而GCI的微流路外置在的設(shè)計(jì)既不會使樣品揮發(fā),又避免了微流路堵塞的風(fēng)險(xiǎn),可實(shí)現(xiàn)120h無人值守運(yùn)行。因此當(dāng)樣品量繼續(xù)增加到96個(gè)樣品以后,GCI與BLI(8通道)通量相當(dāng),且無需對分析物進(jìn)行梯度稀釋,大大節(jié)約了樣品準(zhǔn)備時(shí)間。
總結(jié)
各位小伙伴可能對GCI技術(shù)很感興趣或心存疑問,如想進(jìn)一步了解或希望嘗試DEMO樣機(jī),可聯(lián)系support@oeta.com.cn。
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